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中华损伤与修复杂志(电子版) ›› 2016, Vol. 11 ›› Issue (02) : 120 -121. doi: 10.3877/cma.j.issn.1673-9450.2016.02.009

所属专题: 文献

短篇论著

严重烫伤大鼠早期胫骨前肌组织中微小RNA表达谱数据的靶基因分析
张海军1, 郝岱峰1, 柴家科1,(), 郁永辉1   
  1. 1. 100048 北京,解放军总医院第一附属医院全军烧伤研究所,烧伤整形科,创口修复中心
  • 收稿日期:2016-01-09 出版日期:2016-04-01
  • 通信作者: 柴家科
  • 基金资助:
    全军后勤科技重点专项(BWS14J48,BWS14J49)
  • Received:2016-01-09 Published:2016-04-01
引用本文:

张海军, 郝岱峰, 柴家科, 郁永辉. 严重烫伤大鼠早期胫骨前肌组织中微小RNA表达谱数据的靶基因分析[J/OL]. 中华损伤与修复杂志(电子版), 2016, 11(02): 120-121.

目的

初步确定严重烫伤大鼠早期胫骨前肌组织中差异表达微小RNA(miRNA)的靶基因,从而为进一步机制研究指明方向。

方法

采用高通量芯片技术检测严重烫伤大鼠早期胫骨前肌miRNA表达谱数据,筛选部分差异明显且相关性较好的miNRA,包括miR-1-3p、miR-206-3p、miR-133a-3p、miR-22-3p、miR-30a-5p、miR-30d-3p、miR-190b-5p、miR-628和miR-678,利用互联网络检索数据库Mirbase、Miranda和Mirdb,对这些差异miRNA进行靶基因预测。

结果

3大数据库预测结果显示差异miRNA主要调控79个靶基因,网络关系图显示了miR-1-3p、miR-206-3p、miR-133a-3p、miR-22-3p、miR-30a-5p、miR-30d-3p、miR-190b-5p、miR-628和miR-678等miRNA及其预测靶基因之间复杂的调控网络关系。

结论

根据初步的预测结果,miR-1-3p和miR-206-3p共同调控的靶基因较多,可作为进一步机制研究的理论依据。

图1 miRNA与预测靶基因网络关系图
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